Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc47Q9D024 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms