Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Klhl35Q9CZ49 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl35Q9CZ49 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms