Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp2Q9CYZ8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp2Q9CYZ8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms