Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrs1Q9CYH6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrs1Q9CYH6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rrs1Q9CYH6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrs1Q9CYH6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrs1Q9CYH6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms