Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmed5Q9CXE7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmed5Q9CXE7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms