Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cxxc1Q9CWW7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cxxc1Q9CWW7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms