Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnbl1Q9CWL8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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