Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MINDY3Q9CV28 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MINDY3Q9CV28 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms