Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms