Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRC3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRC3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRC3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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