Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR14

Fancl, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanclQ9CR14 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FanclQ9CR14 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FanclQ9CR14 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FanclQ9CR14 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FanclQ9CR14 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FanclQ9CR14 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FanclQ9CR14 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FanclQ9CR14 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FanclQ9CR14 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FanclQ9CR14 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FanclQ9CR14 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FanclQ9CR14 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms