Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4931417E11RikQ9CR05 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms