Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atg12Q9CQY1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atg12Q9CQY1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms