Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rer1Q9CQU3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rer1Q9CQU3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms