Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PompQ9CQT5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PompQ9CQT5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms