Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rwdd1Q9CQK7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rwdd1Q9CQK7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms