Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ergic3Q9CQE7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ergic3Q9CQE7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ergic3Q9CQE7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ergic3Q9CQE7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ergic3Q9CQE7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ergic3Q9CQE7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic3Q9CQE7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic3Q9CQE7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic3Q9CQE7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic3Q9CQE7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic3Q9CQE7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic3Q9CQE7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic3Q9CQE7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ergic3Q9CQE7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms