Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc5Q9CQA1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc5Q9CQA1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms