Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ubl4bQ9CQ84 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ubl4bQ9CQ84 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ubl4bQ9CQ84 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms