Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms