Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mrpl49Q9CQ40 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mrpl49Q9CQ40 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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