Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms