Protein–RNA interactions for Protein: Q99PP6

Trim34a, Tripartite motif-containing protein 34A, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34aQ99PP6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim34aQ99PP6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim34aQ99PP6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms