Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gtf2a1Q99PM3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2a1Q99PM3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms