Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab27bQ99P58 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab27bQ99P58 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms