Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vgll1Q99NC0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms