Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acss1Q99NB1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acss1Q99NB1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms