Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajb11Q99KV1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajb11Q99KV1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms