Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf34Q99KR6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf34Q99KR6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms