Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab28Q99KL7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab28Q99KL7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab28Q99KL7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms