Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nrif1Q923B3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms