Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Clip1Q922J3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Clip1Q922J3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms