Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grin3bQ91ZU9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Grin3bQ91ZU9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Grin3bQ91ZU9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms