Protein–RNA interactions for Protein: Q91XL2

Lnx2, Ligand of Numb protein X 2, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx2Q91XL2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lnx2Q91XL2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lnx2Q91XL2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms