Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Creb3l3Q91XE9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Creb3l3Q91XE9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms