Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hps3Q91VB4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms