Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn8Q91VA3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn8Q91VA3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms