Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms