Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps4aQ8VEJ9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps4aQ8VEJ9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms