Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SnrkQ8VDU5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnrkQ8VDU5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnrkQ8VDU5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms