Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep57l1Q8VDS7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep57l1Q8VDS7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep57l1Q8VDS7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms