Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDJ3

Hdlbp, Vigilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdlbpQ8VDJ3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HdlbpQ8VDJ3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HdlbpQ8VDJ3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms