Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttc8Q8VD72 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc8Q8VD72 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttc8Q8VD72 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms