Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt25Q8VCW2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms