Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rufy2Q8R4C2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rufy2Q8R4C2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms