Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg10Q8R1P4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms