Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colec12Q8K4Q8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colec12Q8K4Q8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colec12Q8K4Q8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colec12Q8K4Q8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colec12Q8K4Q8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colec12Q8K4Q8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colec12Q8K4Q8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colec12Q8K4Q8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colec12Q8K4Q8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Colec12Q8K4Q8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Colec12Q8K4Q8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms