Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q7

Cerk, Ceramide kinase, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerkQ8K4Q7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CerkQ8K4Q7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CerkQ8K4Q7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms