Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nsl1Q8K305 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nsl1Q8K305 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms