Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Paf1Q8K2T8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Paf1Q8K2T8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms